Scientific papers
Nature Genetics, January 2009, Volume 41, Number 1
Common variants in the NLRP3 region contribute to Crohn's disease susceptibility
Alexandra-Chloe Villani, Mathieu Lemire, Genevieve Fortin, Edouard Louis, Mark S Silverberg, Catherine Collette, Nobuyasu Baba, Cecile Libioulle, Jacques Belaiche, Alain Bitton, Daniel Gaudet, Albert Cohen, Diane Langelier, Paul R Fortin, Joan E Wither, Marika Sarfati, Paul Rutgeerts, John D Rioux, Severine Vermeire, Thomas J Hudson & Denis Franchimont
abstract
We used a candidate gene approach to identify a set of SNPs, located in a predicted regulatory region on chromosome 1q44 downstream of NLRP3 (previously known as CIAS1 and NALP3) that are associated with Crohn’s disease. The associations were consistently replicated in four sample sets from individuals of European descent. In the combined analysis of all samples (710 father-mother-child trios, 239 cases and 107 controls), these SNPs were strongly associated with risk of Crohn’s disease (Pcombined ¼ 3.49 109, odds ratio ¼ 1.78, confidence interval ¼ 1.47–2.16 for rs10733113), reaching a level consistent with the stringent significance thresholds imposed by whole-genome association studies.
LIST OF PARTICIPANTS
Legend: Coordinating PI Participants
| 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9 | 10 | 11 | 12 | 13 | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| BE-SMART | CEDAR-UC | Combined therapy of biologicals and new oral drugs. | DETECT | DNA banking | GENGISCAN | HELP-AID | I-CARE | Immunization | LOVE | PACIFIC | Pediatric | SPARE | |
| Karen Van Hoeve | |||||||||||||
| - - | x | x | x | x | |||||||||
| Leila Amininejad | x | x | x | ||||||||||
| Saskia Appelmans | |||||||||||||
| Thomas Billiet | |||||||||||||
| Patrick Bontems | |||||||||||||
| Isabelle Bueres | |||||||||||||
| Katrien Bulté | |||||||||||||
| Guillaume Burnet | |||||||||||||
| Peter Burvenich | |||||||||||||
| Julie Busschaert | |||||||||||||
| Philippe Caenepeel | |||||||||||||
| Olivier Cajot | |||||||||||||
| Christophe Claessens | x | ||||||||||||
| Jean-Charles Coche | |||||||||||||
| Jean-Louis Coenegrachts | |||||||||||||
| Arnaud Colard | x | ||||||||||||
| Filip Couturier | |||||||||||||
| Lara Crapé | |||||||||||||
| Anneline Cremer | |||||||||||||
| Anneline Cremer | x | x | |||||||||||
| Cléo Croonen | |||||||||||||
| Francois D'Heygere | x | ||||||||||||
| Steven De Coninck | |||||||||||||
| Leentje De Facq | |||||||||||||
| Elisabeth De Greef | x | ||||||||||||
| Marc De Maeyer | |||||||||||||
| Marc De Reuck | |||||||||||||
| Elodie De Ruyck | |||||||||||||
| Nicolas de Suray | |||||||||||||
| Martine De Vos | x | x | x | x | |||||||||
| Benedicte De Vroey | |||||||||||||
| Astrid De Zutter | |||||||||||||
| Stefan Delen | |||||||||||||
| Marie-Armelle Denis | |||||||||||||
| Pieter Dewint | x | x | |||||||||||
| Olivier Dewit | x | x | x | ||||||||||
| Sophie Dewit | x | x | |||||||||||
| Joris Dutre | |||||||||||||
| Anke Engelen | |||||||||||||
| Marc Etienne | |||||||||||||
| Marc Ferrante | x | x | x | x | x | ||||||||
| René Fiasse | |||||||||||||
| Fernand Fontaine | x | x | |||||||||||
| Denis Franchimont | x | x | x | x | x | x | |||||||
| Silke François | |||||||||||||
| Jeroen Geldof | |||||||||||||
| Bruno Hauser | |||||||||||||
| Pieter Hindryckx | x | ||||||||||||
| Ilse Hoffman | |||||||||||||
| Tom Holvoet | |||||||||||||
| Alice Hoyois | |||||||||||||
| Evelien Humblet | x | ||||||||||||
| Saskia Ilegems | |||||||||||||
| Aranzazu Jauregui Amezaga | |||||||||||||
| Guy Lambrecht | x | x | x | ||||||||||
| Pierre Lammens | |||||||||||||
| Katrien Lecluyse | |||||||||||||
| Claire Liefferinckx | x | ||||||||||||
| Triana Lobaton | |||||||||||||
| Edouard Louis | x | x | x | x | x | ||||||||
| Elisabeth Macken | x | ||||||||||||
| Marie-Christine Mairlot | |||||||||||||
| Jean-Marc Maisin | |||||||||||||
| Fazia Mana | x | ||||||||||||
| Ludwig Marchal | |||||||||||||
| Walter Margos | |||||||||||||
| Fady Mokaddem | |||||||||||||
| Kim Moubax | |||||||||||||
| Vinciane Muls | |||||||||||||
| Carmen Musala | |||||||||||||
| Michele Ngassa | |||||||||||||
| Maja Noman | |||||||||||||
| Hanne Ooms | |||||||||||||
| An Outtier | |||||||||||||
| Romy Ouziel | |||||||||||||
| Harald Peeters | |||||||||||||
| Annelies Posen | |||||||||||||
| Philippe Potvin | |||||||||||||
| Lieven Pouillon | |||||||||||||
| Jean-Francois Rahier | x | x | x | x | x | x | |||||||
| Catherine Reenaers | x | x | x | ||||||||||
| João Sabino | |||||||||||||
| João Sabino | |||||||||||||
| Michael Schapira | |||||||||||||
| Patrick Schoenaers | |||||||||||||
| Nathalie Schoofs | |||||||||||||
| Nele Schoofs | |||||||||||||
| Alexandra Sermeus | |||||||||||||
| Francoise Smets | |||||||||||||
| Michaël Somers | |||||||||||||
| Dirk Staessen | |||||||||||||
| Marjan Steppe | |||||||||||||
| Beatrijs Strubbe | x | ||||||||||||
| Jo Swinnen | |||||||||||||
| Clara Thienpont | |||||||||||||
| Marie Truyens | |||||||||||||
| Haydeh Vafa | |||||||||||||
| Stephanie Van Biervliet | |||||||||||||
| Frank Van De Mierop | |||||||||||||
| Gaëtan Van Den Steen | |||||||||||||
| Edwin Van der Wijst | |||||||||||||
| Jurgen Van Dongen | |||||||||||||
| Evi Van Dyck | |||||||||||||
| Andre Van Gossum | |||||||||||||
| Karen Van Hoeve | |||||||||||||
| Philippe Van Hootegem | x | x | |||||||||||
| Catherine Van Kemseke | |||||||||||||
| Wouter Van Moerkercke | x | x | x | ||||||||||
| Steven Van Outryve | |||||||||||||
| Stijn Vanden Branden | x | x | x | x | |||||||||
| Katrien Vandenbroucke | |||||||||||||
| Sofie Vanderhasselt | |||||||||||||
| Liv Vandermeulen | |||||||||||||
| Jo Vandervoort | |||||||||||||
| Laura Vansteenkiste | |||||||||||||
| Gigi Veereman | x | ||||||||||||
| Severine Vermeire | x | x | x | ||||||||||
| Annelies Verreth | |||||||||||||
| Bram Verstockt | |||||||||||||
| Sophie Vieujean | |||||||||||||
| Francis Weyn | |||||||||||||
| Barbara Willandt |